1991)提出植物内生菌是指生活史的一定阶段生活在活体植物组织内又不引起植物明显病害的微生物。此定义被大家广泛接受。最早提出内生菌概念的是Bary，从1886年提出后的大约100年间，内生菌的研究进展缓慢。直到1993 年，美国蒙大拿州立大学Strobel c妇从短叶紫杉(Taxus breviforlia)分离到一株内生真菌，它能产生与宿主植物产生同一产物的肿瘤治疗剂紫杉醇，启发了人们可以从植物内生菌寻找植物产生的相同或相似的化合物，扩大了药用微生物资源的范围，从而植物内生菌的研究开始迅速发展。高等植物是复杂多样的，有数十万种，每一种都有一种或多种内生菌与之共生，植物为各种各样的微生物提供生存环境。在内生菌与宿主植物长期协同进化过程中，彼此构成了稳定的生态关系。由于植物与内生菌相互间基因交换的结果，使内生菌具有产生某些与植物相同或相似化合物的能力，因此，可作为天然活性物质的重要来源。而新物种通常都会有新的功能基因，新基因又意味着新的天然产物。