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大豆MIKC型MADS—box基因家族分析

《分子植物育种》2009年 第3期 | 胡瑞波 范成明 李宏宇 林辰涛 傅永福   国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程 中国农业科学院作物科学研究所 北京100081 Department of Molecular Cell and Developmental Biology University of California Los Angeles 90095 American
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摘 要:根据拟南芥的MIKC型MADS—box蛋白序列构建HMM(hidden markov model)模型,在大豆基因组中确定了57个MIKC型MADS-box同源基因。分子进化树分析表明,57个大豆MIKC型MADS-box基因分为14个亚类,而MIKC^+型基因又分为两个进化支。控制花形态建成的ABCDE同源异型基因(如AP1,AG,AP3和PI等)和重要的控制开花时间的基因(如SVP和SOCl)在大豆基因组中表现出多拷贝的特征。MEME和SMART分析表明,大豆和拟南芥MIKC型MADS—box基因具有保守的MADS和K-box基序,还有一些亚类具有特异的基序。MIKC型MADS—box基因结构较为保守,多数基因具有7~8个外显子。本研究得到的MIKC型MADS—box基因为下一步研究大豆花形态建成和开花时间调控的分子机制提供了重要参考依据。
【分 类】【农业科学】 > 农作物 > 禾谷类作物 > 【农业科学】 > 农作物 > 禾谷类作物 >
【关键词】 大豆 MIKC型MADS—box 保守基序
【出 处】 《分子植物育种》2009年 第3期 429-436页 共8页
【收 录】 中文科技期刊数据库

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