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松萝凤梨转录组测序分析

《分子植物育种》2019年 第11期 | 金亮 田丹青 詹书侠 安霞 葛亚英 王炜勇   浙江省农业科学院花卉研究开发中心 国家花卉工程技术研究中心凤梨研发与推广中心 杭州311202
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摘 要:松萝凤梨(Tillandsia usneoides)是空气凤梨的一种,可以“生长在空气中”,主要通过叶片吸收水分和养分。为探讨松萝凤梨叶片功能的遗传基础,本研究采用高通量测序技术对其叶片进行转录组测序。总计获得了62 779条单基因簇(Unigene)。对所得Unigenes进行不同数据库注释,其中34 419条Unigenes在数据库中有注释,占总Unigenes数目的54.82%。在Nr、Nt和SwissProt数据库中,分别有7条、10条、13条Unigenes与根相关;GO数据库注释显示25 695条Unigenes分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类55个功能组,其中与根相关Unigenes达到48条;KOG数据库中注释到的13 205条Unigenes功能系统分为26类;KEGG代谢通路分析表明,5 574个Unigenes涉及250条通路,其中34条Unigenes涉及景天酸代谢(CAM)途径。本研究结果为松萝凤梨分子生物学方面研究提供了一定的基础及参考。
【分 类】【农业科学】 > 农作物 > 饲料作物、牧草 > 多年生禾本科牧草 > 黑麦草
【关键词】 松萝凤梨 转录组 测序 基因分析 功能注释
【出 处】 《分子植物育种》2019年 第11期 3497-3506页 共10页
【收 录】 中文科技期刊数据库

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