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毛果杨ITPK家族基因的鉴定及特性分析

《分子植物育种》2019年 第20期 | 李新林 金华 邹吉祥 金纯伊 朱桐 程文琼 王铸 樊家昊   大连民族大学环境与资源学院 大连116600
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摘 要:1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶(ITPK)作为磷脂酰肌醇信号通路的一种重要的调控酶,在动物、植物、线虫的生物信号传导和生长发育中起到重要作用。为了进一步对毛果杨中ITPK家族基因进行系统分析,利用毛果杨的基因组数据库,通过生物信息学方法,对毛果杨ITPK基因家族的基因结构、染色体位置、蛋白结构域、细胞定位预测、系统进化、基因表达进行了分析。结果表明:毛果杨中的ITPK家族基因共有6个成员,分布于毛果杨的6条染色上。进化树分析显示毛果杨ITPK基因可分为3个亚家族;基于保守域分析显示,Pt ITPK1~PtITPK5均含有3个保守结构域,Pt ITPK6只含有2个保守结构域;毛果杨ITPK基因在各个器官或组织中均有表达。研究结果为进一步克隆该家族基因与验证ITPK家族基因与生物逆境胁迫相关提供科学依据。
【分 类】【医药、卫生】 > 肿瘤学
【关键词】 毛果杨(Populus trichocarpa) 1 3 4-三磷酸肌醇5/6激酶(ITPK) 生物信息学分析
【出 处】 《分子植物育种》2019年 第20期 6632-6638页 共7页
【收 录】 中文科技期刊数据库