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基于叶绿体DNA单倍型的蒙古沙冬青遗传多样性格局探究

《分子植物育种》2019年 第4期 | 沈奇 潘月云 臧春鑫 赵志平 关潇 张银东   海南大学热带农林学院 海口570228 中国环境科学研究院 北京100012
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摘 要:为保护第三纪孑遗种质资源蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus),使用叶绿体非编码片段psbC-trnS对蒙古沙冬青9个野生居群的cpDNA进行测序,分析中国内蒙古阿拉善左旗和鄂尔多斯高原地区范围内,不同居群间的叶绿体非编码区序列差异以及沙冬青的遗传多样性格局。结果表明:排序后的序列总长度为1 493~1 545 bp,共计110个变异位点,根据序列变异位点共确定出12种单倍型,其中H2单倍型分布最广。通过单倍型建树和单倍型网络分析推测出单倍型H2为可能的祖先单倍型。物种水平上单倍型多样性(Hd)指数为0.297 48,核苷酸多样性(π)指数为0.001 66;居群水平上Hd指数介于0~0.813 19之间。总的遗传多样性Ht为0.309 (0.090 3)高于居群间基因多样性Hs为0.293 (0.078 4),基因交流大部分在居群内部。居群间的遗传分化系数NST=0.018小于GST=0.053 (p>0.05,不显著),表明居群不存在明显的谱系地理结构。中性检验结果认为内蒙古西部地区沙冬青居群拒绝中性进化,群体历经扩张或者基因座位受到负选择作用,符合古老孑遗种说法。通过遗传变异分析提出内蒙古特有种沙冬青的保护策略,进一步的保护建议为实施就地保护、迁地杂交等措施。
【分 类】【生物科学】 > 植物学 > 植物细胞遗传学
【关键词】 沙冬青 CPDNA 遗传多样性
【出 处】 《分子植物育种》2019年 第4期 1378-1384页 共7页
【收 录】 中文科技期刊数据库