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EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片的建立及其方法学分析

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李沛[1] 凌志强[2] 赵继敏[1] 杨洪艳[1] 黄幼田[1] 董子明[1]

[1]郑州大学基础医学院病理生理学教研室,郑州450052 [2]Shiga University of Medical Science, Japan 520-2192

《郑州大学学报：医学版》

2006年第41卷第2期

摘　　要:

目的：建立食管癌EC109细胞CDNA微矩阵基因芯片，并对其可靠性进行验证。方法：提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA，逆转录得CDNA，再逆转录得CRNA，用Cy3-duTP标记EC109细胞CRNA，用Cy5-duTP标记正常食管上皮细胞CRNA，制备表达谱探针，利用该探针对EC109细胞与正常食管上皮细胞进行杂交。荧光扫描基因芯片，筛选表达谱。利用自身比较实验、重复实验和R^2、一致率（C冠）及假阳性率（即冠）等指标对该基因芯片系统进行方法学分析。结果：该基因芯片系统2次实验结果的符合率达85％，R^2=0．7329，CR=100％。该系统的FPR为0．45％，扩增样品与无扩增样品的基因表达谱表现出较好的吻合性。结论：该芯片系统具有良好的稳定性、可靠性及低误差率等特点，可用于基因差异表达谱的分析。 (共3页)