摘 要:
对传染性支气管炎病毒LH2／01／10的S1和S2基因分别进行RT—PCR扩增、克隆和序列测定。结果表明，其S基因由3495个核苷酸组成，编码的多肽由1164个氨基酸残基组成。S蛋白的切割识别位点氨基酸组成为组氨酸—精氨酸—精氨酸—精氨酸—精氨酸(HRRRR)。推测其裂解后形成的S1和S2亚单位中，S1由539个氨基酸残基组成，S2由625个氨基酸残基组成。序列分析发现：LH2／01／10与Beau、M41、CU—T2、D1466、DE072、Holte、Gray、Ark99、Conn、H52、KB8523、SD／97／02、ZJ971和LX4毒株S基因推导的氨基酸同源性在63％～96％之间。其中与国内分离毒株SD／97／02和LX4氨基酸的同源性均在95％以上，三者切割识别位点也相同。但与另一国内分离株ZJ971氨基酸的同源性仅为75％，而与国外毒株之间在83％以下。切割识别位点也与ZJ971和所选的国外参考毒株代表性的RRF／SRR位点不同。与这些参考毒株相比，LH2／01／10S基因在76～78位缺失TCT碱基，在67～69位插入TCT碱基，105位和549位氨的基酸发生点突变。总体来看，SD／97／02的S1基因推导的氨基酸序列与国内外已报道的42株参考毒株同源性较低，在52％～96％之间。与国内分离毒株亲缘关系相对较近，其中与国内近年来不同地区分离的A2、LX4、SD／97／02、TJ／96／02、JX／99／01、SAIBWJ和Z等毒株在进化树分析中属于同一亚群，氨基酸同源性也在81％以上。与H120等疫苗株的氨基酸同源性在75％以下，同源性较低。在S1基因编码蛋白的3个高变区和6个抗原表位内，LH2／01／10与该亚群内的致肾脏病变型毒株同源性均较高。由此可见，LH2／01／10与国内分离的毒株具有较近的亲缘关系，与疫苗株H120 S1基因的低同源性以及LH2／01／10S基因本身的缺失、插入和点突变造成的变异可能是导致该毒株在IBV H120疫苗免疫鸡群中致病的主要原因。
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