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我国分离的盖塔病毒衣壳蛋白基因和3′非翻译区分子特征研究

《病毒学报》2007年 第4期 | 翟友刚 王焕琴 付士红 梁国栋   中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 北京100052
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摘 要:对我国海南省和河北省分离到的3株盖塔病毒(GETV)(M1、HB0215-3和HB0234)进行衣壳蛋白基因和3′UTR区序列测定,并分析比较该病毒的分子生物学遗传特征。首先应用逆转录聚合酶链反应扩增出病毒衣壳蛋白基因和3′UTR片段,纯化后连接到载体中进行测序,然后用Clastal X和DNASTAR软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用MEGA软件绘制系统发生树。3株病毒衣壳蛋白基因分别由801、804和804个核苷酸组成,分别编码267、268和268个氨基酸,3株病毒之间核苷酸和氨基酸序列同源性为97.6%-100%和97.8%-100%,与其他GETV分离株核苷酸同源性在95.4%-99.6%之间。3株病毒3′UTR分别由411、401和401个核苷酸组成,发现中国株存在10个(45-54位)核苷酸缺失和2个(64位、148位)特有的核苷酸位点。进化分析表明盖塔病毒之间的进化关系与分离年代相关,中国境内流行的盖塔病毒是相对独立的一个类群。
【分 类】【医药、卫生】 > 基础医学 > 医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学) > 人体病毒学(致病病毒) > 节肢动物传播的病毒(虫媒病毒)
【关键词】 盖塔病毒 衣壳蛋白基因 3′非翻译区 核苷酸序列 系统发生树
【出 处】 《病毒学报》2007年 第4期 270-275页 共6页
【收 录】 中文科技期刊数据库

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