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中国柯萨奇病毒B5的全基因组测序及其序列分析

《病毒学报》2010年 第4期 | 胡永峰 赵丽娜 董杰 吴志强 杜江 薛颖 杨帆   中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、病毒基因工程国家重点实验室 北京100052 中国医学科学院病原生物学研究所 北京100176 华北煤炭医学院生物科学系 唐山063000
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摘 要:本文对我国首株与手足口病相关的柯萨奇病毒B5(01/CVB5/SD/CHN/09,CVB5/09)进行了基因组测序并与现有的相关序列进行了比较和进化分析。CVB5/09基因组长7399nt,共编码氨基酸2185aa,与现有的CVB5基因组核酸序列相似性在80.6%~85.3%之间,氨基酸序列相似性在96.1%~96.9%。进化分析发现,利用不同的基因组片段P1、P2和P3区构建的进化树中,CVB5/09分别处在不同的进化分支上,不同基因组片段有着不同的进化速率。Simplot相似性分析没有发现基因组有明显的重组发生。本文完成了我国第1株柯萨奇病毒B5全基因组序列的测定,通过与其它相关病毒的比较分析深入了解其遗传特征,以期为手足口病的流行病学调查和预防控制提供有价值的信息。
【分 类】【医药、卫生】 > 基础医学 > 医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学) > 人体病毒学(致病病毒) > 肠道病毒与肝炎病毒 > 柯克萨基(Coxsackie)族
【关键词】 手足口病 柯萨奇病毒B5 基因组测序 序列分析
【出 处】 《病毒学报》2010年 第4期 283-289页 共7页
【收 录】 中文科技期刊数据库