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贵州省2011年急性胃肠炎诺如病毒的哨点监测及其基因特征分析

《病毒学报》2013年 第1期 | 阎岩 吴悦 郭军 田克诚 王定明   贵州省疾病预防控制中心传染病防治研究所 贵阳550004 贵州省人民医院儿科 贵阳550002
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摘 要:为了解贵州省2011年诺如病毒的基因型,监测了2011年5月至12月于贵州省人民医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)初步鉴定,并对阳性株的VP1基因区克隆及测序。检测标本70份,GⅠ型诺如病毒阳性1株,阳性率1.43%,GⅡ型诺如病毒阳性34株,阳性率48.57%,获得7份GⅡ型诺如病毒VP1基因序列,3株为GⅡ.4亚型,为新型变异株(GⅡ4 2011),与GⅡ4 2006b变异株的亲缘关系最近,有1个氨基酸位发生了回复突变;4株为GⅡ.3亚型,分为2个基因簇,1簇与2008~2009年韩国株(HM635118)及上海株(GU991355)的亲缘关系最近,1簇与2010年日本株(AB629943)及2007年印度株(EU921389)等的亲缘关系最近,有4个氨基酸位点易发生回复突变。
【分 类】【医药、卫生】 > 基础医学 > 医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学) > 人体病毒学(致病病毒) > 肠道病毒与肝炎病毒
【关键词】 诺如病毒 GⅡ4型 GⅡ3型 VP1基因 贵州
【出 处】 《病毒学报》2013年 第1期 51-55页 共5页
【收 录】 中文科技期刊数据库

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