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2008~2014年中国6省市流行的人呼吸道合胞病毒B亚型G蛋白编码基因特征分析

《病毒学报》2019年 第2期 | 宋金华 王慧玲 石晶 崔爱利 杜佳 杨子峰 孙利伟 张蕾 张红 张燕 许文波   国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室 北京102206 北京市大兴区亦庄医院 北京102600 广州医科大学第一附属医院呼吸疾病国家重点实验室 广州呼吸疾病研究所 广州510120 长春市儿童医院 长春130061 陕西省疾病预防控制中心 西安710054 湖南省疾病预防控制中心 长沙410005 安徽理工大学医学院 淮南232001
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摘 要:人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是引起婴幼儿下呼吸道感染的主要病原体之一。HRSV粘附蛋白(Attachment glycoprotein,G)是病毒膜表面糖蛋白,介导保护性免疫,是抗HRSV抗体和疫苗等的研究热点之一。为研究2008~2014年中国HRSV B亚型G蛋白编码基因的基因特征,于2008~2014年收集的363份HRSV阳性临床标本或病毒株中挑选89份代表株进行G蛋白编码基因全长核苷酸序列的扩增和测序,使用Sequencher 5.0进行序列的编辑,使用MEGA 5.0进行序列比对和亲缘关系进化树构建以及氨基酸变异分析。89份代表株分别挑选自中国北京、吉林、广东、河北、湖南、陕西6省市发热呼吸道感染患者鼻咽拭子或病毒分离株,基因型包括BA9、BA10、BAc、BA、CB1及SAB4,覆盖我国近年流行的优势基因型。亲缘关系分析显示,89株代表株可以分为6个分支,同一基因型G蛋白编码基因核苷酸序列荟聚为一个分支;89份代表株之间的核苷酸(氨基酸)遗传距离为0.03(0.04),与原型株CH-18537株的核苷酸(氨基酸)遗传距离为0.08~0.10(0.14~0.18),其中B5分支与原型株的核苷酸(氨基酸)遗传距离最远为0.10(0.18);氨基酸变异主要在第二高变区,其次为第一高变区。在中心保守区(aa164~176)以及CX3C模序区,89条HRSV B亚型G蛋白编码基因氨基酸序列与原型株CH-18537株一致。本研究表明2008~2014年中国HRSV B亚型G蛋白编码基因变异较多,但在中心保守区和CX3C模序区保守,本研究为我国HRSV的病毒学研究提供了基础科学数据。
【分 类】【医药、卫生】 > 基础医学 > 医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学) > 人体病毒学(致病病毒) > 呼吸道传染性病毒
【关键词】 人呼吸道合胞病毒B亚型(HRSV B) G蛋白 氨基酸 变异
【出 处】 《病毒学报》2019年 第2期 211-219页 共9页
【收 录】 中文科技期刊数据库

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