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广东省三株蚊媒黄病毒的鉴定和系统进化分析

《病毒学报》2019年 第2期 | 吴德 李柏生 谈琦琪 张欣 张欢 曹玉玺 王环宇 梁国栋   广东省疾病预防控制中心病原微生物检验所 广州511430 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 北京102206
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摘 要:为了解广东省蚊媒病毒的种类和分子特征,本研究对从蚊子中分离的三株黄病毒提取病毒核酸并进行二代测序,经序列拼接和比对,基因组序列中缺失的 gap 通过 RT -PCR 进行扩增填补。用 MEGA 软件登录 GenBank 下载黄病毒代表株序列并绘制进化树,同时用 Clustal W2 软件与新毒株进行氨基酸同源性比对和编码框序列的分析。结果显示利用二代测序技术获得了三株病毒基因组序列的 96.35%~98.26%,并用 RT-PCR 成功补齐所有 gap,序列比对显示其中一株与黄斑库蚊病毒核苷酸和氨基酸同源性 98.51%,两株病毒与广平病毒的核苷酸同源性分别为97.30%和 89.78%。三株病毒都属于黄病毒家族中的未分类黄病毒或昆虫特异性黄病毒,编码区序列中 C 蛋白的同源性最低,NS5 的同源性最高。本研究发现的三株蚊媒黄病毒中,库蚊黄斑病毒在国内为首次鉴定;两株广平病毒核苷酸同源性存在较大差异,可能存在不同基因亚型。
【分 类】【医药、卫生】 > 基础医学 > 医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学) > 人体病毒学(致病病毒) > 节肢动物传播的病毒(虫媒病毒)
【关键词】 致倦库蚊 黄斑库蚊病毒(CTFV) 广平病毒(QBV) 系统进化分析
【出 处】 《病毒学报》2019年 第2期 240-246页 共7页
【收 录】 中文科技期刊数据库

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