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基于高通量测序技术分析番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道转录组学的变化

《病毒学报》2019年 第2期 | 李鸿文 黄诗杭 骆钰 吴晓平 王全溪 李健 黄一帆 吴异健   福建农林大学动物科学学院 福州350002 晋江市农业局 泉州362200 福建省兽医中药与动物保健重点实验室 福州350002
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摘 要:番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)感染雏番鸭可导致肠道黏膜受损,造成肠黏膜免疫功能低下甚至丧失。为寻找番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道组织免疫相关的差异表达基因,本研究建立番鸭呼肠孤病毒自然发病模型,在感染后 3d、6d、21d 采集同居感染组和对照组试验雏番鸭的空肠,对其进行高通量测序,对差异表达基因进行 GO 功能分类和 KEGG 数据库分析。结果显示,感染后 3d、6d 和 21d 分别筛选出 2 297、5 860 和 3 721 个差异表达基因;GO 分子功能结果显示,免疫相关差异表达基因主要和免疫球蛋白的产生、T 细胞活化和单核细胞趋化性等有关;KEGG 通路富集结果显示,差异表达基因主要涉及在吞噬体、细胞溶质 DNA 传感途径、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Jak-STAT 信号通路和 RIG-I 受体信号通路;荧光定量 RT-PCR 对差异表达基因进行验证,其结果与转录组学结果基本一致。本研究为进一步阐明 MDRV 感染导致雏番鸭肠道损伤和黏膜免疫抑制的机制奠定基础。
【分 类】【农业科学】 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医基础科学 > 家畜微生物学(兽医病原微生物学) > 家畜病毒学
【关键词】 番鸭呼肠孤病毒(MDRV) 黏膜免疫 转录组 差异表达基因
【出 处】 《病毒学报》2019年 第2期 278-287页 共10页
【收 录】 中文科技期刊数据库

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