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基于RNA-seq分析美洲大蠊提取物对结直肠癌细胞信号通路的影响

《四川动物》2017年 第6期 | 陈峰 陈佳松 彭锐 耿福能 邹方东   四川大学生命科学学院 成都610065 四川省药用动物工程技术研究中心 成都610065 药用美洲大蠊四川省重点实验室 成都610065
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摘 要:美洲大蠊Periplaneta americana提取物能够抑制多种肿瘤细胞生长,甚至能使肿瘤细胞发生凋亡,但是其对结直肠癌细胞信号通路的影响尚不清楚。本文基于RNA-seq技术初步分析了美洲大蠊提取物联合顺铂处理结直肠癌细胞后,细胞内信号通路的变化。结果表明:30 μM顺铂和0.6%康复新液联合处理组与对照组相比,共有1 901个差异基因,其中1 555个基因表达上调,346个基因表达下调;30 μM顺铂和0.8%精粉酵解液联合处理组与对照组比,共有2 587个差异基因,其中2 183个基因表达上调,404个基因表达下调;30 μM顺铂和100 μg·mL-1精粉联合处理组与对照组相比,共有1 488个差异基因,其中1 164个基因表达上调,324个基因表达下调。用WEGO和DAVID进行差异基因的GO和KEGG富集分析发现,美洲大蠊提取物联合顺铂处理组与对照组相比,表达上调的差异基因主要富集在p53、细胞粘附分子、MAPK、细胞凋亡等信号通路;表达下调的差异基因主要富集在氨基酰-tRNA生物合成、氨基酸生物合成、抗生素生物合成、一碳代谢等信号通路。
【分 类】【生物科学】 > 昆虫学 > 昆虫生理学 > 昆虫毒理学
【关键词】 美洲大蠊 提取物 转录组 差异基因 信号通路 功能注释
【出 处】 《四川动物》2017年 第6期 649-656页 共8页
【收 录】 中文科技期刊数据库