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湾鳄(Crocodylus porosus)线粒体基因组全序列结构分析与鳄类系统发生

李艳 吴孝兵 季学峰 晏鹏 GeorgeAmato   安徽师范大学生命科学学院 芜湖241000 Molecular Systematics Laboratory American Museum of Natural History New York
摘要:该文测序了湾鳄的线粒体基因组全序列,全长为16,917bp。湾鳄mtDNA结构与其他脊椎动物相似,由22个tRNA,2个rRNA和13个蛋白质编码基因及1个非编码的控制区(D-loop)所组成。除NADH6和tRNA^Gln、tRNA^Ala。、tRNA^Asn、tRNA^Cys、tRNA^Tyr、tRNA^Ser(UCN)、tRNA^Glu、tRNA^ProL-链上编码之外,其余基因均在H-链编码。基因排列顺序与已测序的鳄类一致,这显示了鳄类线粒体基因排列顺序上的保守性。但鳄类线粒体基因排列顺序与脊椎动物的典型排列方式相比,有较大的差异,尤其是tRNA^phe基因的重排、tRNA^Ser-tRNA^His-tRNA^Lcu基因族的排列方式等。湾鳄mtDNA和已测序的鳄类一样,缺失轻链复制起始点(OLR)。基于17种鳄mtDNA控制区保守区,采用PAUP4.0最大简约法(Maximum parsimony,MP)构建MP树,邻接法(Neighbor-joining method,NJ)构建NJ树,结果显示:食鱼鳄(Gavialis gangeticus)和假食鱼鳄(Tomistoma schlegelii)聚为一支后再与鳄科(Crocodylidae)的其他物种形成姐妹群,这与基于食鱼鳄和假食鱼鳄的线粒体全序列的分析结果一致,支持将食鱼鳄并入鳄科的观点。结果还支持非洲窄吻鳄(Crocodylus cataphracms)与鳄属(Crocodylus)构成姐妹群,可以单独划分为属的观点。
格式:PDF     页数:10 页     页码范围:119-128页
学科分类:
关 键 词:湾鳄 线粒体基因组 系统发生
来源期刊:《遗传学报》2007年 第2期
收录数据库:中文科技期刊数据库
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