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玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆与生物信息学分析

《山东林业科技》2019年 第2期 | 康希泉 亓帅 臧德奎 郑林 徐宗大 邢树堂 于晓艳   胜利油田胜大园林工程有限公司 山东东营257000 山东农业大学 山东泰安271000 青州市花卉产业管理局 山东青州262500
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摘 要:为了探明胼胝质对玫瑰授粉亲和性的影响,本研究以‘唐红’玫瑰花柱为试材,采用RT-PCR和RACE方法获得了玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因的cDNA全长,命名为RrCalS。该基因全长5742 bp,开放阅读框5295 bp,编码1764个氨基酸。推导编码蛋白的分子量为204.7kD, PI值为9.00,在164-265位具有pfam14288结构域,在869-1642位具有pfam02364保守结构域,属于葡聚糖合成酶超家族;该蛋白属于疏水性、非分泌型蛋白,具有16个跨膜结构域,含有32个Ser磷酸化位点、21个Thr磷酸化位点、12个Tyr磷酸化位点;该蛋白的α-螺旋占49.49%,无规则卷曲占22.68%,β-转角占7.94%;该蛋白与Fragaria vesca等8种植物的Cals氨基酸序列同源性达73%以上,且它们的系统进化关系与传统分类结果一致。本研究为进一步深入研究玫瑰授粉不亲和机理,提高玫瑰育种理论和技术水平奠定了基础。
【分 类】【农业科学】 > 园艺 > 观赏园艺(花卉和观赏树木) > 观花树木类 > 蔷薇、玫瑰、月季
【关键词】 玫瑰 β-1 3-葡聚糖合成酶 基因克隆
【出 处】 《山东林业科技》2019年 第2期 8-11页 共5页
【收 录】 中文科技期刊数据库