内转录间隔区序列植物系统与进化植物系统学是生物学中最古老的学科，它研究植物的多样性及植物问的相互关系，包括植物的分类鉴定与命名以及各类群植物的进化关系的探索。传统的植物系统学都是建立在表现型性状分析的基础之上，这些性状来自解剖学、孢粉学、细胞学或植物化学。从分子遗传学角度来看，表现型的不同是基因型差异的反映。分子遗传学的发展为植物系统学研究开辟了广阔的前景。植物分子系统学研究的基本方法之一是对不同植物的特定DNA序列进行同源性比较并以此探讨它们的系统演化关系，构建系统树。因结构和功能上的差异，植物基因组以及同一基因组内的不同区域序列的进化速率并不相同。一般来说，核基因组进化最快，进化速率约为叶绿体基因组的2倍，线粒体基因组进化最慢，还不到叶绿体基因组的三分之一l-1 ；而就同一基因组内不同区域序列的变异速度来说，一般情况下非编码区序列(包括内含子和基因问隔区)因其功能上的限制较少，比编码区表现出更快的进化速率l 。这些序列在进化速率上的差异为不同分......