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摘 要:转录因子结合位点的识别是生物信息学中的一个重要领域.本文从计算机等信息科学的角度,对转录因子结合位点的识别方法进行了综合分析,包括该问题的生物学意义、主要算法思想以及每种算法的优缺点.使用TRANSFAC数据库中几组样例对具有代表性的6种主要软件进行测试,对其结果进行了详细地比较分析.最后,在总结分析现有算法的基础上探讨了该领域进一步的研究方向.
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【分 类】 | 【生物科学】 > 生物工程学(生物技术) > 仿生学 |
【关键词】 | 转录因子结合位点 模体 基于字串 期望最大化(EM)算法 吉布斯采样 |
【出 处】 | 《电子学报》2007年 第B12期 83-89页 共7页 |
【收 录】 | 中文科技期刊数据库 |