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浅色黄姑鱼线粒体16SrRNA基因片段序列特征分析

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童馨[1,2] 杜博[1,2] 喻达辉[2] 龚世园[1] 郭奕惠[2] 黄桂菊[2] 李莉好[2,3]

[1]华中农业大学水产学院,武汉430070 [2]中国水产科学研究院南海水产研究所,广州510300 [3]上海水产大学生命科学与技术学院,200090

《海洋水产研究》

2007年第28卷第3期

摘　　要:

PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16SrRNA基因片段序列，得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对，得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明，5条序列包括两个单倍型，两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR—RFLP分析结果显示，两个种群的100个样品中98％的个体为其中一种单倍型，只有2％的个体呈另一种单倍型，表明这两个种群的遗传多样性较低。两个单倍型平均碱基组成为：T22．0％，C26．3％，A29．8％，G21．9％，GC含量平均为48．2％。与GenBank中石首鱼科7属9种的11条同源序列比对，得到429个比对位点，其中包括69个简约信息位点、55个单突变子和16个插入／缺失位点。聚类分析显示，浅色黄姑鱼与黄姑鱼亲缘关系较近，与形态分类相符。 (共7页)