新城疫病毒SDWF2003株F基因的克隆与分子特征分析

肖跃强 沈志强 刘吉山 管宇 韩玲 都广君 王金良

山东省滨州畜牧兽医研究院山东省畜禽用蜂胶疫苗研究开发推广中心,山东滨州256600

摘  要:

将新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)SDWF2003株经10日龄SPF鸡胚增殖后,提取病毒基因组RNA,并以此为模板,RT-PCR扩增获得与F基因预期大小一致的DNA片段,亚克隆到pMD18-T载体并酶切鉴定正确后进行测序。软件分析显示:基因全长1662bp,编码553个氨基酸,裂解住点为^112R-R-Q-K-R-F^117,是典型强毒株氨基酸序列结构;此分离毒株属于基因Ⅶ型,该型F蛋白第101位、第121位特征性氨基酸残基分别是K(赖氨酸)和V(缬氨酸),而本研究分离病毒F蛋白第101位、第121位分别是Q(谷氨酰胺)和V(缬氨酸);同源性比较,与LaSota、F48E9、Ch99核苷酸同源性分别为84.4%、87.1%、98.9%,氨基酸同源性分别为88.3%、91.7%、98.4%。

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