μ-calpain激活因子UK114的克隆与序列分析

常泓[1] 南庆贤[2] 岳文斌[3]

[1]山西农业大学生命科学学院,太谷030801 [2]中国农业大学食品学院,北京100083 [3]山西农业大学动物科技学院,太谷030801

摘  要:

构建了山羊肝脏cDNA文库,采用平板裂解法提取噬菌体DNA,以此为模板用所设计的引物以PCR法扩增出μ-calpain激活蛋白UK114基因,并克隆到pGEM-Teasy载体。序列分析表明,UK114 cDNA包括起始密码子和终止密码子在内全长共计1017bp,5'非编码区长为39bp,3'非编码区长为567 bp,编码区长411 bp,编码137个氨基酸序列。与GenBank中Colombo等所得UK114基因比较表明:在5’非编码区,UK114为102 bp,克隆的UK114为39 bp,且二者仅有9个核苷酸序列是相同的;紧接着是起始密码子ATG,然后是一个411bp的阅读框(40nt-450at),编码137个氨基酸,理论分子量约为15ku,二者在编码区仅有1个bp不同,为无义突变;在3’非编码区为552 bp,所克隆的UK114为567 bp,二者在此区域有57个核苷酸序列是不同的:UK114为polyA,所克隆的是不同的核苷酸。二者的同源性为91%,突变的86个核苷酸中都为无义突变,开放阅读框中仅有一个核苷酸突变。

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