基于贝叶斯网络的DNA序列剪接位点预测

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摘　　要:

采用基于贝叶斯网络的建模方法，预测真核生物DNA序列中的剪接位点．分别建立了供体位点和受体位点模型，并根据两种位点的生物学特性，对模型的拓扑结构和上下游节点的选择进行了优化．通过贝叶斯网络的最大似然学习算法求出模型参数后，利用10分组交互验证方法对测试数据进行剪接位点预测。结果显示，受体位点的平均预测准确率为92．5％，伪受体位点的平均预测准确率为94．0％，供体位点的平均预测准确率为92．3％，伪供体位点的平均预测准确率为93．5％，整体效果要好于基于使用独立和条件概率矩阵、以及隐Markov模型的预测方法．表明利用贝叶斯网络对剪接位点建模是预测剪接位点的一种有效手段． (共6页)