摘 要:
ncRNA和mRNA一样，都是重要的功能分子。以k-tuple（k字）含量为特征，对酵母ncRNA成熟序列和mRNA的编码区、上游序列与下游序列进行了分类与比较研究，结果显示：基于ncRNA成熟序列与mRNA编码区的3-tuple的含量，ncRNA和mRNA的交叉有效性分类精度（leave-one out cross—validation，LOOCV）平均值达到93．93％；基于上游序列4-tuple和5-tuple的含量，分类精度分别为92．49％和92．76％；基于下游序列4-tuple和5-tuple的含量，分类精度分别为91．58％和90．60％；利用上游序列和下游序列的4-tuple与5-tuple的含量，其平均分类精度分别为94．68％和94，83％；通过t检验，得到了在ncRNA和mRNA上、下游序列中具有显著统计学差异的k-tuple。上述结果表明，基于ncRNA成熟序列与mRNA编码区的3-tuple含量和基于ncRNA与mRNA上、下游序列的4或5-tuple含量可以有效地区分ncRNA与mRNA。此研究结果不仅有助于准确识别ncRNA与mRNA，还有助于发现ncRNA特异的转录因子结合位点。 (共7页)
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