用离散量的方法识别蛋白质的超二级结构

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摘　　要:

用离散量的方法，对2208个分辨率在2.5A以上的高精度的蛋白质结构中四类超二级结构进行了识别。从蛋白质一级序列出发，以氨基酸（20种氨基酸加一个空位）和其紧邻关联共同为参数，当序列模式固定长取8个氨基酸残基时，对“822”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到78，1％，jack-knife检验的平均预测精度达到76．7％；当序列模式固定长取10个氨基酸残基时，对“1041”序列模式3交叉检验的平均预测精度达到83．1％，jack-knife检验的平均预测精度达到79.8％。