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赤拟谷盗全基因组和EST中微卫星的丰度

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张琳琳[1] 魏朝明[1] 廉振民[1,2] 孔光耀[1]

[1]陕西师范大学生命科学学院,西安710062 [2]延安大学,延安716000

《昆虫知识》

2008年第45卷第1期

摘　　要:

微卫星是近年大力开发的一种分子标记，为了推进赤拟谷盗Tribolium castabeum（Herbst）遗传学相关研究，对赤拟谷盗全基因组和EST中由1～6个碱基重复单元组成的简单序列重复进行分析，进而对其微卫星的丰度和分布进行比较分析。微卫星在赤拟谷盗EST中的分布频率为1／0．87kb，其中单碱基重复序列占71．25％，是最丰富的重复单元，而六、三、四、二，五碱基重复单元序列分别占23．93％，2．94％，1．56％，0．17％，0．15％。全基因组中微卫星的分布频率为1／3．65kb，其中六碱基重复序列占61．96％，是最丰富的重复单元，而三，四，一，五，二碱基重复单元序列分别占14．35％，13．75％，4．68％，3．60％，1．69％。同时发现富含A和T碱基的微卫星占主导地位，富含G和C碱基的微卫星数量较少。进一步的分析显示，微卫星在每条染色体上的丰度存在很大的相似性。