西伯利亚蓼rd22基因的克隆与序列分析

郑磊 刘关君 杨传平

东北林业大学林木遗传育种省级重点实验室,哈尔滨150040

摘  要:

以3% NaHCO3溶液胁迫处理48h的西伯利亚蓼为试材,利用RACE技术,从其茎部组织克隆了脱水应答蛋白RD22的全长cDNA序列.测序后的结果分析表明,该cDNA序列全长为1302 bp,5'非翻译区为59bp,3'非翻译区为25bp,开放读码框为1218bp,编码405个氨基酸.在氨基酸序列的C端含有一个比较保守的BURP结构域,N端含有5个重复序列THV-VGKGGV-V.信号肽检测证明该蛋白为分泌性蛋白,前21个氨基酸区域为信号肽结构.其推演的氨基酸序列与葡萄的同源性最高,达到60%.该基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为DQ836050.

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