摘 要:
利用生物信息学方法对与儿童蜡样质脂褐质沉积症（NCLs）相关基因CLN3，的结构进行了深入的分析．根据CLN3的mRNA序列对其进行了染色体精确定位，确定CLN3的ORF及其外显子的位置；分析CLN3蛋白质（CLN 3P）结构特点和修饰位点，并明确近缘种及远缘种的保守区域和突变致病的关系．结果表明，CLN3位于人类16号染色体的短臂（16（p12．1～p11．2））；基因全长为14804bp，包含15个外显子和14个内含子，ORF长度1317bp，编码438个氨基酸．蛋白质功能域分析表明，CLN 3P是一种分子量为43kDa的高度糖基化的溶酶体膜蛋白，该蛋白存在酰基化、糖基化和多种磷酸化修饰位点，在近缘的CLN 3P中存在高度保守的区域，进一步对10个远缘蛋白的多序列进行比对，发现了该蛋白质中最为保守的区域；45种CLN 3P的突变分析显示，主要的突变位于101、161～162、170、187、199、211、295、327、330、334、352等12个氨基酸位点，这些突变几乎发生在保守区域，突变还表现出一定的分布特点及地区差异，说明保守序列的突变是该疾病产生的重要原因，为该病的分子诊断提供了依据．
