您的位置:网站首页 > 《中文科技期刊数据库》 > 医药卫生 > 基础医学 > 医学微生物学 > 摘要

5种高危型HPVE7蛋白B细胞表位的预测

《中国病原生物学杂志》2017年 第1期 | 尹小丽 王学政 代运章 张士娥 朱有名 鲁艳芹 韩金祥   济南大学山东省医学科学院医学与生命科学学院 山东济南250022 山东省医学科学院 山东省医药生物技术研究中心 山东济南250062 山东青岛正方元信公共卫生检测有限公司 山东青岛266109
购物车 | ★ 收藏 | 分享
论文服务:
摘 要:目的预测并分析我国人群常见人乳头瘤病毒HPV16、18、33、52与58亚型E7蛋白的线性B细胞表位。方法在NCBI数据库中获取5种高危型HPVE7蛋白氨基酸序列,采用ClustalX2软件进行多序列比对;运用ExPASY服务器SOPMA和GOR4法预测二级结构,采用Kyte-Doolittle方案和Hopp-Wood方案预测亲水性;运用Bepipred和ABCpred软件预测B细胞表位,辅以抗原性指数,综合评判几率较大的B细胞优势表位。结果综合多参数分析,5种HPV亚型的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,其中预测的HPV16与52亚型的第16-21位氨基酸序列一致性为100%,均为QPETTD;HPV16型第28-41位(LNDSSEEEDEIDGP)与HPV52型第28-38位(LGDSSDEEDTD)的氨基酸序列一致性为78%;HPV16型第42-50位(AGQADEPRA),HPV33型第31-46位(SSDEDEGLDRP),HPV52型第36-46位(DTDGVDRPDGQ)和HPV58型第73-78位(TTTDVR)为各自的特异B细胞表位。结论生物信息学方法预测5种HPV的B细胞表位均集中在蛋白质的N端2-50位附近,同时具有特异的B细胞表位(18型除外),可为宫颈癌的诊断、预防和新型疫苗的研制提供参考。
【分 类】【医药、卫生】 > 基础医学 > 医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学) > 人体病毒学(致病病毒) > 其他病毒
【关键词】 人乳头瘤病毒 E7蛋白 B细胞表位 比对 预测
【出 处】 《中国病原生物学杂志》2017年 第1期 34-37页 共4页
【收 录】 中文科技期刊数据库