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费氏中华根瘤菌HN01pmrA所在基因簇的结构分析

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曹永强[1] 隆文杰[1] 梁善范[1] 陈钢[1] 陆祖军[1] 武波[1,2,3]

[1]广西大学生命科学与技术学院,广西南宁530005 [2]广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西南宁530005 [3]广西大学微生物及植物遗传工程教育部重点实验室,广西南宁530005

《广西农业生物科学》

2007年第26卷第1期

摘　　要:

经原位杂交，从费氏中华根瘤菌HN01基因组文库中钓出含有pmrA基因的阳性克隆pGXHN300，对其进行亚克隆测序得到pmrA两翼6．8kb的DNA序列。生物信息学分析显示，该序列包括6个完整的ORF和1个不完整ORF。pmrA所在的基因簇含有4个0RF：ORFa、ORFb、ORFc、ORFd（pmrA）。其中，0RFa与Rhizobium etli的cysG（CAA04958．1）在氨基酸水平一致性为79％，相似性为87％。对ORFc序列分析发现与亚硫酸及亚硝酸还原相关的保守结构域。通过融合PCR方法，将两个潜在的启动子序列分别连在gus上游，以pTR102为载体导入HN01中。在完全培养基YMA上两个启动子均不表达，在以硝酸钠为氮源，亚硫酸钠、硫酸钠或甲硫氨酸分别为硫源的MM培养基上生长均表达出GUS活性，表明这两个潜在的启动子与硫、氮代谢相关。 (共6页)