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海绵来源放线菌的分类鉴定及次生代谢产物的研究认领

作者：

秦琪

学位授予单位：

上海海洋大学

摘要：

海洋放线菌因独特的生态环境，及其次生代谢产物而具有独特的生物活性和丰富的结构，是陆生放线菌被过度发掘后的可替代性药源微生物。海绵是最古老的动物，体内富集了高密度的菌群，海绵宿主与共附生菌群经过数亿年漫长的进化和互相选择，含有大量特有、新颖或未知的放线菌类群，是海洋放线菌的重要来源，蕴藏着丰富的遗传多样性和巨大的次生代谢潜力，是新奇放线菌和新天然活性分子发现的重要来源。　　为进一步探明我国南海地区海绵共附生放线菌的多样性，积累新奇的海洋放线菌资源，从中发现新颖结构的活性天然产物分子。本课题对采自南海海绵Leucetta chagosensi中的共附生微生物进行菌种分离鉴定，根据观察菌落形态，结合16SrRNA测序鉴定菌株种属排重，发现菌株隶属19个属的102个菌种，其中马杜拉属(Actinomadura)有1个菌种，壤霉菌属(Agromyce)有2个菌种，拟无枝菌酸菌属(Amycolatopsis)有11个菌种，芽孢杆菌(Bacillus)有1个菌种，乳酪短杆菌属(Brevibacterium)有1个菌种，短波单胞菌属(Brevundimonas)有2个菌种，迪茨氏菌属(Dietzia)有2个菌种，戈登氏杆菌属(Gordonia)有4个菌种，两面神菌属(Janibacter)有1个菌种，Krasilnikoviella有1个菌种，小单孢菌属(Micromonospora)有6个菌种，诺卡氏菌属(Nocardiopsis)有18个菌种，野野村氏菌属(Nonomuraea)有1个菌种，云南原小单孢菌属(Promicromonospora)有6个菌种，假单胞菌属(Pseudomonas)有8个菌种，假诺卡氏菌属(Pseudonocardia)有8个菌种，链霉菌属(Streptomyces)有26个菌种，Qipengyuania 有 1个菌种，根瘤菌属(Rhizobium）有2个菌种。其中发现11个新种，1个新属。基于Neighbor-Joining(NJ),Maximum-Parsimony(MP)和 Maximum-Likelihood(ML)算法，采用MEGA7.0对其中分离得到的一个菌株Actinomadura进行系统发育进化分析，确定分离自Leucetta chagosensis海绵的菌株LHW52907为马杜拉菌属的新种，并命名为Actinomadura spongiicola,对其展开多相分类鉴定研究。　　此外对分离得到的102个菌种进行六种水产病原菌的活性筛选，所选水产病原菌分别是溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)、副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)、杀香鱼假单胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)、杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)、大肠杆菌(Escherichia coli)、沙门氏菌(Salmonella)，筛选结果显示链霉菌属中的一株Streptomyces somaliensis菌对溶藻弧菌、杀香鱼假单胞菌、沙门氏菌均具有较为显著的抗菌活性。选定该菌株(Streptomyces somaliensis sp. nov.编号为Y2)进行后续次生代谢产物研究。实验通过运用凝胶柱色谱，薄层色谱，硅胶柱色谱，反相柱色谱等等色谱手段，从大发酵所得浸膏中分离纯化得到15个已知化合物，其中11个环二肽，3个脂肪酸，1个酰胺类化合物。运用核磁共振等波谱技术确定单体化合物的结构。　　以上研究结果表明，南海海绵Leucetta chagosensis中的共附生微生物种类丰富，存在新的分类单元，并且具有较强的微生物次生代谢产物开发和应用的潜力。本文对海绵放线菌资源的收集和分类具有重要的海洋生物资源战略意义。

摘要译文

关键词：

海绵来源放线菌; 菌落形态; 分类鉴定; 次生代谢产物

学位年度：

2023

学位类型：

硕士

学科专业：

食品科学与工程

导师：

林厚文

中图分类号：

Q939.132.09;Q939.9[应用微生物学]

学科分类号：

071003[微生物学]