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云南地区76株结核分枝杆菌的基因型分布特征及耐药分析认领

作者：

桂海成

学位授予单位：

昆明医科大学

摘要：

【目的】了解云南地区76株结核分枝杆菌基因型的分布特征。阐明云南省结核患者MTB的基因型与耐药分子特征之间的关系,为结核防控提供有价值的信息。【方法】1.收集云南省传染病医院检验科结核室,2021年04月至2021年10月结核培养阳性菌株76株,采用MIRU-VNTR15位点分型技术进行基因分型,用软件将分型结果进行聚类分析,根据成簇计算近期传播率。2.利用一代测序技术进行耐药突变位点的检测,了解该地区结核杆菌的耐药情况,基因型与耐药性是否相关。【结果】1.76株MTB临床分离株15个VNTR位点检测结果显示,Hunter-Gaston指数从0.103到0.815,分辨力高的位点是Mtub21、MIRU26、MIRU31、Mtub4、QUB11b、QUB26、QUB4156;分辨力的中等位点是Mtub39、MIRU10、Mtub30、ETR A、MIRU16、MIRU40;低分辨力位点是ETR C、MIRU4。2.76株结核杆菌分型得到三个家族基因群,分别是北京型52株、NEW-1型18株和URAL型6株。产生70种基因型。独特基因型68(89.5%)种,余成4簇,每簇2株,共8(10.5%)株,成簇率5.3%。3.基因分型与性别、年龄、治疗史初治复治、HIV感染、影像征象及地域分布对比差异分析无统计学意义(P>0.05)4.成簇型与独特型在性别、年龄、分型、治疗史初治复治及地域分布差异分析无统计学意义(P>0.05)。5.药敏试验共发现16种耐药相关的氨基酸突变,分别是inh A基因中C15T氨基酸突变,kat G基因中S315T氨基酸突变,rpo B基因中D516V、H526R、S531Q、L533P氨基酸突变,emb B基因中M306I、M306V氨基酸突变,rps L基因中K88R氨基酸突变,Gyr A基因中A90V、G88C、D89N、D94G、D94A、D94Y,rrs基因中A1401G氨基酸突变。6.药敏显示该地区76株MTB总耐药率35.5%(27/76),单耐药率18.4%(14/76),多耐药率11.8%(9/76),耐多药率5.3%(4/76)。北京型52株、非北京型24株,北京型耐药率为40.4%(21/52),非北京型耐药率为25%(6/24)。7.基因分型与kat G基因中S315T氨基酸突变相关分析差异有统计学意义(P<0.05);基因分型与异烟肼药物耐药相关分析差异有统计学意义(P<0.05)。8.全敏感结核患者和耐药结核患者在性别、年龄、基因成簇和分型方面无统计学意义(P>0.05);在结核病史初治复治方面差异有统计学意义,初治耐药率明显低于复治耐药率(P<0.05)。【结论】1.Mtub21、MIRU26、MIRU31、Mtub4、QUB11b、QUB26、QUB4156七个位点是云南省76例结核患者MTB基因分型的首选位点,具有明显的遗传多态性。北京基因型菌株在云南省广泛分布,为占绝对优势的菌株,不同地州基因型群存在差异,大部分与总体的流行趋势相符。2.云南北京型MTB耐药率高于非北京型,且与kat G基因中S315T氨基酸突变和异烟肼药物耐药有统计学差异。

摘要译文

关键词：

结核分枝杆菌; 基因分型; 耐药结核; 耐药突变位点

学位年度：

2024

学位类型：

硕士

学科专业：

临床检验诊断学

导师：

邰文琳

中图分类号：

R52[结核病⑨]

学科分类号：

100201[内科学]

D O I：

10.27202/d.cnki.gkmyc.2024.001584